滋賀県でプール付きのホテルを一覧にしました。
ハイシーズンの週末価格を参考価格とし、価格が安いもの順に並べました。

びわ湖大津プリンスホテル
全長90m、最大幅23mにも及ぶ巨大プール(夏季のみ)があるホテルです。
深さ30cmのプールもあるため、小さな子連れでも安心です。
プール利用券付きプランを選ぶか、宿泊料金に一人1,000円を追加するとプール利用ができます。
彦根ビューホテル
宿泊者は、無料でプールを利用(夏季のみ)できます。
水深1.2mの大人用プールと、水深30cmの幼児用プールがあります。
琵琶湖マリオットホテル
縦25m・横10mの温水プール(水深1.2m)があります。
宿泊者は税込830円で利用できます。
ビートバンや幼児用アームヘルパーは無料で借りることができます。
ダイヤモンド滋賀ホテル
全長110mの流水プールや25mプールなどの室内プール(夏季のみ)があります。
宿泊者は1人につき大人・子ども500円、幼児300円です。
びわ湖リゾート白浜荘
夏季のみの屋外プールがあります。
料金は、大人800円、子ども400円です。
また、目の前には、「近江白浜水泳場」もあります。
里湯昔話 雄山荘
主に子ども向けのこじんまりしたガーデンプール(夏季のみ)があります。
全長は20mです。
琵琶湖グランドホテル・京近江
ホテルの隣に、「雄琴臨水プール」(市営プール)があります。
大人用プールと、幼児用のプールがあります。
プール無料券の有無については、事前に確認してください。
琵琶湖ホテル
最長26m、幅20mのプール(夏季のみ)です。
水深1.2mの大人向けプールと、水深60cmの子ども向けプールがあります。
料金(1名あたり)は大人1,500円、子ども1,000円です。
土日・お盆期間は上記に500円追加になります。
ホテル&リゾーツ長浜
縦25m・横12mの大人用プール(水深110cm)と、直径7mの円形の子ども用プール(水深50cm)があります(夏季のみ)。
料金(1名あたり)は、大人1,000円、小学生500円です。
休暇村 近江八幡
水深90cmのプールと、水深40cmのプールがあります(夏季のみの屋外プール)。
料金は、大人330円、小学生220円、幼児110円です。
また、ホテルの目の前には宮ヶ浜水泳場があります。
ホテルレイクヴィラ
25mの大人用プールと、幼児用プールがあります(夏季のみの屋内プール)。
宿泊者は無料で利用できます。
おごと温泉 びわこ緑水亭
「びわこ緑水亭」から徒歩5分のところに「雄琴臨水公園プール(市民プール)」があります。
宿泊者には、「雄琴臨水公園プール」無料券のプレゼントがあります。